Католическая община в Томске была основана в 1816 году монахами-иезуитами. Позже в приходе работали монахи-бернардинцы, а после распада СССР - епархиальные священники. С 2014 года в Томске снова служит община иезуитов.
Полное название – «Католическая община Покрова Пресвятой Богородицы Царицы Святого Розария».
Католический храм Пресвятой Богородицы, который сейчас располагается по адресу ул. Бакунина 4, был построен в 1833 году. В октябре 2020-го года ему исполнится 187 лет.
На сегодняшний день Томский приход является одним из самых больших приходов в Сибири и насчитывает около 400 прихожан. Он относится к Преображенской епархии с центром в Новосибирске, возглавляемой епископом Иосифом Вертом.
Помимо прихода в Томске, католики проживают в Северске, а также в сёлах и деревнях Томской области: с. Кривошеино, с. Белосток, с. Малиновка.
В 1993 году по инициативе прихожан была основана Католическая гимназия. На сегодняшний день в ней обучаются около 170 учеников. Набор производится вне зависимости от национальности, вероисповедания и социального положения.
Община Томской католической церкви довольно активная на сегодняшний день: ежедневно проходят службы, существуют различные молитвенные группы, хор, работает семейный центр «Назарет» и проходят экуменические мероприятия.